1. Exploració de l'aparell digestiu: la gastroscòpia permet l'observació de la mucosa esofàgica, gàstrica i duodenal, revelant lesions com gastritis i úlceres gàstriques.
La colonoscòpia examina el còlon i el recte, ajudant en el diagnòstic de colitis, pòlips de còlon i càncer de còlon. També es poden obtenir mostres de teixit mitjançant pinces de biòpsia per a l'anàlisi patològica.
2. Examen de l'aparell respiratori: la broncoscòpia s'utilitza per examinar la tràquea i els bronquis, revelant lesions com ara infeccions pulmonars, cossos estranys bronquials i càncer de pulmó. També permet procediments com el rentat broncoalveolar per ajudar en el diagnòstic.
3. Exploració del sistema urinari: la ureteroscòpia i la cistoscòpia permeten l'accés a l'urètre i la bufeta, observant la mucosa uretral i vesical i les obertures ureterals, ajudant en el diagnòstic de càlculs renals, tumors vesicals i estenosis uretrals.
4. Exploració ginecològica i obstètrica: la histeroscòpia permet l'observació directa de la cavitat uterina, diagnosticant malalties ginecològiques com pòlips endometrials, fibromes submucosos i adherències intrauterines.